Subarbusto ou arbusto ramificado ca. 1 m alt., ramos tomentosos, tricomas tectores alvoacinzentados, aumentando em direção ao ápice, intumescidos nos nós.
Folhas sésseis, cartáceas, obovadas ou oblanceoladas, discolores, venação craspedódroma ou semicraspedódroma, 1,5-3,2 cm compr., 0,9-1,1 cm larg., ápice agudo ou obtuso, margem serrada, duplamente serrada, crenadoserrada ou dentada, base atenuada, face adaxial tomentosa, face abaxial densamente tomentosa principalmente nas nervuras, ambas as faces com tricomas tectores alvo-acinzentados.
Capítulo esférico; pedúnculo 0,8-1,5 cm compr.; brácteas semelhantes às folhas, porém menores. Flor: bractéolas involucrais lanceoladas ou lineares, 1,7-2 mm compr., 0,1 mm larg., ápice arredondado, hirsutas ou tomentosas,
tricomas tectores; bractéolas internas ausentes; cálice ca. 1,3-2,2 mm compr., campanulado, lobos estreitamente triangulares, lanceolados ou lineares, ápice do lobo arredondado ou obtuso, sem apêndice apical, face interna densamente tomentosa na região mediana do tubo, tricomas tectores, glabra nos lobos, face externa tomentosa na base, hirsuta nos lobos, tricomas tectores ou glandulares, vilosa no receptáculo; corola alva, 2,1 mm compr., 0,3-0,4 mm larg. na base, 1 mm diâm. na fauce, lobos ovais, ápice do lobo arredondado ou obtuso, face interna glabra, face externa hirsuta ou tomentosa, tricomas tectores ou glandulares.
Núculas ovoides, 0,6-0,7 mm compr., 0,4 mm larg., ápice obtuso ou truncado, coloração castanho-clara, glabras, levemente verruculosas.
Hyptis microphylla é uma espécie amplamente distribuída, ocorrendo em áreas alagadas da região norte, no Pará e Roraima, no nordeste, na Bahia e Piauí, no centro-oeste e no sudeste, em Minas Gerais e Rio de Janeiro (Harley et al. 2010). Na Serra do Cipó foi coletada apenas uma vez, com flores e frutos em janeiro.
Fonte: SILVA-LUZ, C. L. da.; GOMES, C. G.; PIRANI, J. R. & HARLEY, R. M. Flora da Serra do Cipó, Minas Gerais: Lamiaceae. Bol. Bot. Univ. São Paulo, v. 30, n. 2, p. 109-155, 2012.